2009年4月，台州市人民政府与浙江清华长三角研究院在北京签订合作框架协议。

2009年12月，浙江清华长三角研究院台州联络处设立。

2014年12月，台州市人民政府与浙江清华长三角研究院举行会商会，商议共同组建清华台州创新中心事宜。

2015年11月，《台州市人民政府与浙江清华长三角研究院关于共同建立台州创新中心框架协议》签订。

2016年4月，台州市机构编制委员会下发《关于建立浙江清华长三角研究院台州创新中心的通知》。

2016年5月，台州创新中心完成了事业法人机构注册登记。

2016年9月，浙江清华长三角研究院台州创新中心揭牌成立。

2017年7月，台州民营经济学院成立。

2017年8月，台州“薪火传承”服务中心成立。

2017年10月，清华台州创新中心孵化器被省科技厅认定为省级科技企业孵化器（专业型）。

2018年9月，台州创新中心与玉环市人民政府签订《关于共同创建玉环水暖阀门产业供应链一体化创新基地的框架协议书》。

2018年10月，台州创新中心质量与品牌研究中心成立。

2019年1月，台州清玉华科技开发有限责任公司成立。

2019年2月，玉环水暖阀门产业创新服务综合体被列入第二批省级产业创新服务综合体创建名录。

2019年9月，台州创新中心设立台州·西雅图海纳孵化器。

2019年10月，浙江清华长三角研究院航空通用技术研究所成立。

2019年11月，浙江省玉环水暖阀门产业创新服务综合体（玉环水暖阀门供应链一体化创新基地）正式启用。

2019年12月，清华台州创新中心孵化器被国家科技部认定为国家级科技企业孵化器（专业型）。

2020年8月，浙江省玉环水暖阀门产业创新服务综合体小山外数智孵化器获评台州市级科技企业孵化器。

2020年12月，浙江省玉环水暖阀门产业创新服务综合体小山外数智孵化园启用。

2021年3月，台州海角高层次人才创业创新服务中心成立。

2021年3月，阀门智能技术应用重点实验室、功率半导体及应用研究重点实验室获评台州市级重点实验室。

2021年5月，台州创新中心及玉环基地智联工业互联网平台同时入选2021年度浙江省中小企业公共服务示范平台。

2021年6月，玉环基地泵阀（水暖阀门）产业大脑入选浙江省第一批行业产业大脑建设试点。

2021年7月，中国机械工程学会台州（玉环）服务站成立（后评为国家级）。

2021年8月，玉环基地智联工业互联网平台入选第二批第一年建议支持的国家中小企业公共服务示范平台。

2021年9月，台州创新中心视觉检测技术应用研发中心成立。

2021年11月，浙江清华长三角研究院航空通用技术研究所研制的鸿鹄翼无人机参展第十三届中国航空航天博览会。

2021年12月，浙江清华长三角研究院和台州市人民政府签订了《关于推进浙江清华长三角研究院台州创新中心建设协议（2021年-2015年）》。

2021年12月，台州创新中心新型材料研究及应用中心成立。

2022年1月，玉环基地泵阀（水暖阀门）产业大脑被评为2021年数字经济系统优秀细分行业产业大脑，并由浙江省经信厅向浙江省数字化改革办公室推荐在全省推广经验。

2022年4月，零碳技术应用示范中心成立。

2022年6月，玉环基地泵阀（水暖阀门）产业大脑作为浙江省唯一入选的产业大脑项目亮相第五届数字中国建设成果展览会。

2022年9月，台州创新中心工业碳中和技术应用研究中心、生物医药研发中心及热能控制系统研究及应用中心成立。

2022年10月，浙江省玉环水暖阀门产业创新服务综合体完成了建设任务，并通过了期满验收考核。

2022年11月，浙江清华长三角研究院航空通用技术研究所研制的鸿鹄翼无人机参展第十四届中国航空航天博览会。

2023年1月，浙江清华长三角研究院台州创新中心完成机构改革，更名为长三角台州创新中心。

2023年3月，台州创新中心与玉环市人民政府签订了《关于共同推进玉环水暖阀门供应链一体化创新基地的框架协议（2023-2027）》。